Die Schulleitung besteht - wie an Gesamtschulen üblich - aus sechs Personen, die für unterschiedliche Bereiche zuständig sind. In der Maria Montessori Gesamtschule sind dies:

Schulleiterin: Petra Cönen

Ständige Vertretung: Solveig Penn

Didaktische Leitung: Dr. Barbara Graeßner

Abteilungsleitung I (Jahrgänge 5-7): Monika Bepple

Abteilungsleitung II (Jahrgänge 8-10): Norman Soemantri

Abteilungsleitung III (Jahrgänge 11-13): Dennis Rütters