Die Schulleitung besteht - wie an Gesamtschulen üblich - aus sechs Personen, die für unterschiedliche Bereiche zuständig sind. In der Maria Montessori Gesamtschule sind dies:

Schulleiterin: Irmgard Braun 
Ständige Vertretung: Petra Cönen 
Didaktische Leitung: Dr. Barbara Graeßner
Abteilungsleitung I (Jahrgänge 5-7): Monika Bepple
Abteilungsleitung II (Jahrgänge 8-10): Barbara Pesch 
Abteilungsleitung III (Jahrgänge 11-13): Ali Daccour